para proyectos grandes se usa un control ve verciones ya sea para poder ver las actualizaciones que se generan, y poder trabajar en equipo.

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Con el control de verciones de tortoiseSVN podemos ver cual es la vercion del proyecto mas nueva y descargarla de un servidor (visualSVN) 

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Si ha varias personas travajando con los mismos archivos se puede realizar un "merge", esto solo aplica en archivos de texto plano como *.c, *.cpp, etc. lo que se hace es crear un nuevo archivo con el contenido de los dos archivos modifidados.

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Siemtre debe de existir una persona que se encargue de revisar las verciones ya que hay veces que el "merge" no se realiza bien o hay que elegir entre si remplazar completamente un archivo, quedarse con la vercion anterior o combinar los archivos.

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en este video pongo como instalar el servidor de verciones VisualSVN y accseder a el con tortoiseSVN en un proyecto de unity3D.